当时康熙皇帝尚不知俄国人重返雅克萨，但他从永戍黑龙江，巩固东北防务的目的出发，于同年九月命筑墨尔根，令将军萨布素及副都统一员率兵驻扎。黑龙江(瑗珲)设副都统驻守。筑城设兵，白应设驿。于是又令户部、兵部、理藩院，再次遣官勘测从吉林乌喇至墨尔根，自墨尔根至黑龙江(瑗珲)宜增驿站数目。包奇等勘测后于十一月提以五尺为度，由吉林城量到墨尔根，又由墨尔根量到瑗珲城，共一千七百一十一里，拟设驿站二十五处。经批准实施。于本年年底至翌年初，正式设置由吉林至茂兴，然后缘嫩江北上，经齐齐哈尔(当时称卜奎村)、墨尔根，越小兴安岭至瑗珲的驿站。如有紧急军情，可从茂兴转向西南，由蒙古驿马飞驰入喜峰口送往京城。新设驿路，在即将开始的第二次雅克萨战役中发挥了巨大作用。
康熙二十五年(1686)二月十三日，事过数月康熙皇帝才得知俄军重新侵占雅克萨的确切消息。他立即部署了第二次雅克萨战役，指示：罗刹复回雅克萨筑城盘踞，若不速行捕剿，其势必积粮坚守，不易收复。令将军萨布素等，速修船舰，统领乌喇、宁古塔官兵驰赴黑龙江城。至日，酌留盛京兵镇守，只率所部两千余人，攻取雅克萨城。福建藤牌兵四百人，令建义侯林兴珠率领前往。四月底，又派副都统郎谈、班达尔善、马喇参赞军务。再次攻取雅克萨的艰巨任务完全由黑龙江本地官兵承担，因而改由黑龙江将军萨布素统领。